Los fagos en los trasplantes fecales están remodelando silenciosamente tu microbioma intestinal

El trasplante de microbiota fecal ha surgido como una herramienta poderosa para tratar la infección recurrente por <i>Clostridioides difficile</i> y se está explorando para afecciones que van desde la enfermedad inflamatoria intestinal hasta los trastornos metabólicos. Sin embargo, la mayor parte de la investigación se ha centrado casi exclusivamente en qué bacterias del donante colonizan con éxito el intestino del receptor, ignorando en gran medida los miles de millones de virus que las acompañan.

Este artículo de perspectiva del APC Microbiome Ireland cuestiona esa visión bacteriocéntrica. Los autores sostienen que los bacteriófagos —virus que infectan bacterias— son participantes activos en la determinación de los resultados del FMT, no meros espectadores pasivos. En concreto, destacan la transferencia horizontal de genes (HGT) mediada por fagos como un mecanismo potencialmente crítico e infravalorado que ocurre tras el trasplante.

Los fagos de origen donante pueden integrarse en las bacterias del receptor, transportando con ellos material genético funcional. Esto incluye genes que regulan rutas metabólicas, mecanismos de respuesta al estrés y —lo más preocupante— determinantes de resistencia a los antibióticos. Los autores proponen un modelo conceptual en el que los fagos actúan como mediadores bidireccionales de la adaptación microbiana, influyendo en las comunidades microbianas tanto del donante como del receptor de maneras que podrían potenciar o socavar los objetivos terapéuticos.

Las implicaciones clínicas son significativas. Si la transferencia génica mediada por fagos contribuye a los resultados del FMT, entonces los protocolos de selección de donantes centrados únicamente en patógenos bacterianos podrían ser insuficientes. La transferencia no intencionada de genes de resistencia a los antibióticos a través de fagos temperados podría suponer riesgos reales para la seguridad, en particular en pacientes inmunodeprimidos. Por otro lado, aprovechar la HGT mediada por fagos podría abrir nuevas vías para la ingeniería de precisión del microbioma.

Se trata de un artículo de perspectiva y no de un estudio de datos originales, lo que significa que el modelo es conceptual y está pendiente de validación empírica. No obstante, representa un replanteamiento importante de cómo el campo debería entender la biología del FMT y la selección de donantes, con relevancia directa tanto para la práctica clínica como para el diseño futuro de investigaciones sobre el microbioma intestinal.