Científicos mapean 661 microbios intestinales vinculados a la salud cardiovascular y metabólica en 34.000 personas

Las enfermedades cardiometabólicas, incluidas las enfermedades cardiovasculares y la diabetes tipo 2, son las principales causas de muerte en los países occidentales, y tanto la mala alimentación como la composición del microbioma intestinal han sido implicadas en su desarrollo. Sin embargo, hasta ahora han faltado estudios sistemáticos, a gran escala y multinacionales que vinculen especies microbianas específicas con marcadores de salud en poblaciones diversas.

Este estudio reunió y armonizó cinco de las cohortes metagenómicas intestinales más grandes hasta la fecha del programa ZOE PREDICT, abarcando 34.694 participantes de Estados Unidos y el Reino Unido. Cada participante aportó muestras de heces para secuenciación metagenómica shotgun, junto con registros dietéticos detallados, mediciones antropométricas (incluido el IMC) y un panel exhaustivo de 37 marcadores clínicos que abarcaban glucemia, perfiles lipídicos, marcadores inflamatorios como GlycA, presión arterial y puntuaciones de riesgo de enfermedad cardiovascular aterosclerótica (ASCVD).

Mediante un enfoque sistemático de aprendizaje automático —que incluía clasificadores de bosque aleatorio y modelos de regresión entrenados con abundancias relativas a nivel de especie— los investigadores encontraron asociaciones consistentes y moderadamente sólidas entre el microbioma y los marcadores de salud indirectos en las cinco cohortes. Entre los marcadores predichos más destacados se encontraron la glucemia en ayunas y posprandial, los triglicéridos, el colesterol y los índices inflamatorios, con valores AUC entre 0,64 y 0,73 y correlaciones de Spearman de 0,30–0,46. Los índices de calidad dietética, como el Healthy Eating Index y el Healthful Plant-Based Diet Index, también mostraron correlaciones significativas con la composición del microbioma.

Para extraer conclusiones accionables, el equipo calculó correlaciones parciales de Spearman (ajustadas por sexo, edad e IMC) entre cada una de las 661 especies microbianas prevalentes y los 37 marcadores de salud, promediando y clasificando posteriormente las especies entre cohortes. Esto dio lugar al «ZOE Microbiome Health Ranking 2025», un resumen reproducible que clasifica los microbios desde los más favorablemente asociados a la salud del huésped hasta los más desfavorablemente asociados. La mayoría de las especies mejor clasificadas —tanto favorables como desfavorables— pertenecían al filo Firmicutes y a la clase Clostridia, en particular a la familia Lachnospiraceae, lo que pone de manifiesto que microbios beneficiosos y perjudiciales pueden coexistir dentro del mismo grupo taxonómico. La clasificación fue validada de forma independiente en más de 7.800 muestras metagenómicas de acceso público y mostró asociaciones sólidas con el IMC y enfermedades en esos conjuntos de datos externos.

De manera relevante, en dos ensayos clínicos de intervención dietética independientes con un total de 746 participantes, la adherencia a patrones dietéticos más saludables se tradujo en aumentos en la abundancia y prevalencia de especies favorablemente clasificadas, y en reducciones de las desfavorablemente clasificadas, lo que aporta un respaldo intervencionista preliminar a la relevancia biológica de la clasificación. Los autores subrayan, no obstante, que se trata de asociaciones observacionales y que establecer causalidad requiere estudios de cohortes prospectivos y ensayos de intervención rigurosamente diseñados. El ZOE Microbiome Health Ranking 2025 se posiciona, con todo, como una base sólida y a gran escala para orientar futuras investigaciones mecanísticas y causales sobre intervenciones dietéticas dirigidas al microbioma intestinal en favor de la salud cardiometabólica.