La thérapie génique remplace la cystéamine quotidienne dans une maladie lysosomale rare
Le premier essai humain de la thérapie génique HSPC pour la cystinose montre un profil de sécurité acceptable et une réduction des niveaux de cystine chez 6 patients adultes.
Résumé
Un essai de phase 1/2 mené à l'UC San Diego a testé CTNS-RD-04, une thérapie génique lentivirale ex vivo délivrant un ADNc *CTNS* fonctionnel dans les cellules souches hématopoïétiques des patients, chez six adultes atteints de cystinose infantile. Après un conditionnement myéloablatif au busulfan et une perfusion de cellules CD34+ corrigées par thérapie génique, tous les patients ont obtenu une reconstitution hématopoïétique soutenue et polyclonale. Sur une période de suivi de 29 à 63 mois, les taux de cystine dans les globules blancs ont diminué chez cinq patients sur six, l'expression de *CTNS* a augmenté de 11 à 49 fois, et aucune expansion monoclonale ni malignité liée au traitement n'a été observée. La cysteamine orale — un schéma thérapeutique contraignant pouvant atteindre 36 comprimés par jour — a été arrêtée avant la perfusion. Les résultats suggèrent qu'un traitement unique par thérapie génique pourrait réduire ou remplacer la thérapie à vie par cysteamine, tout en assurant une élimination de la cystine au niveau tissulaire que les médicaments conventionnels ne peuvent pas atteindre.
Résumé détaillé
La cystinose est une maladie lysosomale de surcharge autosomique récessive rare, causée par des mutations avec perte de fonction du gène *CTNS*, qui code la cystinosine, un transporteur membranaire lysosomal assurant l'exportation de la cystine. En l'absence de cystinosine fonctionnelle, des cristaux de cystine s'accumulent dans la quasi-totalité des organes, provoquant un syndrome de Fanconi rénal dès la petite enfance, une évolution vers l'insuffisance rénale terminale, des lésions cornéennes, une myopathie, des déficits neurologiques, des endocrinopathies et un décès prématuré. Le seul traitement approuvé, la cysteamine, réduit la cystine intracellulaire mais doit être prise toutes les 6 heures par voie orale, associée à des gouttes oculaires toutes les heures pendant les heures d'éveil ; elle retarde la progression de la maladie sans pouvoir l'arrêter.
Des travaux précliniques menés sur des souris Ctns−/− ont établi que la transplantation de cellules souches et progénitrices hématopoïétiques (CSPH) exprimant un gène *Ctns* fonctionnel permettait l'intégration de macrophages dérivés de la moelle osseuse dans les tissus malades, où ils corrigeaient les cellules voisines via des nanotubes tunnelisants — des ponts subcellulaires permettant le transfert lysosomal. S'appuyant sur ces résultats, l'équipe de l'UCSD a développé CTNS-RD-04 : des cellules CD34+ autologues transduits ex vivo avec un vecteur lentiviral auto-inactivant portant l'ADNc de *CTNS*. Six adultes (âgés de 20 à 46 ans) atteints de cystinose infantile ont été inclus entre juillet 2019 et mai 2022. Après mobilisation par G-CSF/plerixafor et leucaphérèse, les cellules ont été transduites puis réinfusées à la suite d'un conditionnement myéloablatif par busulfan. Deux constructions de vecteur lentiviral ont été utilisées au sein de la cohorte (pCCL-CTNS pour les patients 1 à 3 ; pCDY-CTNS pour les patients 4 à 6), et le LentiBOOST a été ajouté pour les patients 5 et 6 afin d'améliorer l'efficacité de transduction. Les doses cellulaires allaient de 3,63 à 9,59 × 10⁶ cellules CD34+/kg, avec des nombres de copies vectorielles (VCN) de 0,59 à 2,91 au moment de la perfusion.
Les six patients ont atteint la prise de greffe neutrophilique à une médiane de 13 jours et la prise de greffe plaquettaire à 19,5 jours. Les VCN sont restés stables jusqu'à 24 mois (0,51 à 2,67 copies par génome diploïde), et l'expression de *CTNS* dans les cellules mononucléées du sang périphérique a augmenté de 11 à 49 fois par rapport à la valeur initiale à 24 mois. L'analyse des sites d'intégration chez l'ensemble des patients a révélé des profils hautement polyclonaux (396 à 85 868 sites uniques par patient), sans expansion monoclonale ni événement leucoprolifératif. Les taux de cystine dans les leucocytes ont diminué par rapport à la valeur initiale chez cinq patients sur six ; le patient 4, qui présentait le VCN le plus faible (0,59), faisait exception. Des réductions des cristaux de cystine tissulaires ont été observées dans des biopsies rectales et cutanées, ainsi que par microscopie confocale cornéenne chez les patients évaluables. Plus de 216 événements indésirables ont été recensés, majoritairement légers ou modérés et imputables au conditionnement par busulfan ou à la cystinose sous-jacente. Quatre événements indésirables sévères sont survenus (appendicite, deux épisodes d'aggravation de la maladie rénale chronique et une maladie coronarienne préexistante nécessitant une hospitalisation) ; aucun n'a été attribué à CTNS-RD-04. Deux patients ont contracté le SARS-CoV-2 après la perfusion, ce qui a retardé la reconstitution immunitaire.
La justification mécanistique distingue cette approche d'une simple substitution enzymatique : les macrophages greffés s'intègrent physiquement dans les tissus et transfèrent des lysosomes fonctionnels aux cellules hôtes via des nanotubes tunnelisants, offrant potentiellement une élimination durable de la cystine à l'échelle de l'organisme entier. L'arrêt de la cysteamine orale avant la perfusion et des gouttes oculaires un mois après le conditionnement — s'il se maintenait — réduirait considérablement la charge thérapeutique. Cinq des six patients ont été inclus dans une étude de suivi à long terme de 13 ans, permettant d'évaluer la durabilité des effets.
Cette première thérapie génique par cellules souches hématopoïétiques chez l'humain pour la cystinose démontre un profil de sécurité acceptable et une efficacité biomarqueur prometteuse sur une période pouvant atteindre cinq ans. Des essais plus larges et contrôlés, menés chez des patients plus jeunes (avant l'installation de lésions organiques étendues), sont nécessaires pour déterminer si les bénéfices fonctionnels — préservation du DFG, clarté cornéenne, force musculaire — sont cliniquement significatifs et durables.
Principales conclusions
- All 6 patients achieved stable, polyclonal hematopoietic engraftment with VCNs of 0.51–2.67 at 24 months.
- CTNS expression rose 11–49-fold above baseline in peripheral blood at 24 months post-infusion.
- WBC cystine levels declined in 5 of 6 patients; the one exception had the lowest vector copy number.
- 216 adverse events recorded; none attributed to CTNS-RD-04; no monoclonal expansion or leukoproliferative events observed.
- Oral cysteamine (mean 36 pills/day) was successfully discontinued before infusion in all participants.
Méthodologie
Essai de phase 1/2 ouvert, monocentrique (UCSD), ayant recruté 6 adultes atteints de cystinose infantile ; des HSPC CD34+ autologues ont été transduites ex vivo avec des vecteurs lentiviraux auto-inactivants codant pour CTNS, puis réinfusées après un conditionnement myéloablatif au busulfan. Le critère d'évaluation principal était la tolérance ; les critères secondaires comprenaient le VCN, l'expression de CTNS, la cystine leucocytaire, la charge en cristaux de cystine sur biopsies tissulaires, la microscopie confocale cornéenne, le DFGe, et des évaluations neuromusculaires sur une durée de 29 à 63 mois.
Limites de l'étude
La cohorte était restreinte (n=6), exclusivement adulte et composée en grande partie de patients ayant subi une transplantation rénale, ce qui limite la généralisabilité aux patients plus jeunes chez qui l'intervention aurait le plus grand impact. Deux constructs de vecteurs lentiviraux différents ont été utilisés selon les patients, ce qui complique les comparaisons inter-patients. L'étude ne dispose pas d'un groupe témoin concurrent, et le suivi au-delà de 5 ans est toujours en cours ; les bénéfices fonctionnels à long terme au niveau des organes n'ont pas encore été confirmés.
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