Les tests standard de dépistage du cancer passent à côté de 75 % des carcinomes NUT mortels, révèle une étude

Le carcinome NUT représente l'une des formes de cancer les plus agressives, avec une survie médiane de seulement 6,7 mois après le diagnostic. Ce cancer rare mais mortel est défini par des fusions géniques spécifiques impliquant le gène NUTM1, le plus souvent avec les protéines BRD4, BRD3 ou NSD3. Malgré son pronostic dévastateur, une importante nouvelle étude révèle que les méthodes standard de tests génétiques ne parviennent pas à détecter la majorité des cas.

Des chercheurs ont analysé 116 patients atteints de carcinome NUT issus d'un registre international, en examinant l'efficacité de différentes approches diagnostiques pour identifier les fusions NUTM1 définissant ce cancer. Les résultats sont frappants : le séquençage de nouvelle génération standard basé sur l'ADN, considéré comme la référence actuelle pour les tests génétiques en oncologie, n'a détecté que 21,6 % des carcinomes NUT. Même le test d'ADN tumoral circulant a affiché des performances similairement faibles, à 21,4 %. En revanche, les tests de fusion basés sur l'ARN ont identifié 83,9 % des cas, tandis que l'immunohistochimie et les tests FISH ont atteint des taux de détection quasi parfaits.

La population de patients présentait des caractéristiques distinctives susceptibles d'aider les cliniciens à reconnaître les cas potentiels. L'âge médian était de seulement 38 ans, avec 40,5 % de femmes. Fait remarquable, 92,9 % des patients avaient un historique tabagique minime ou nul, ce qui distingue le carcinome NUT des cancers pulmonaires typiques. La majorité des tumeurs se développaient dans la région thoracique (62,9 %) ou dans la tête et le cou, et la plupart présentaient des fusions BRD4::NUTM1 (58,8 %).

Au-delà des difficultés diagnostiques, l'étude a mis en lumière des informations importantes concernant le paysage moléculaire du carcinome NUT. Ces tumeurs présentaient une charge mutationnelle extrêmement faible (médiane de 1,0 mutation par mégabase) et une expression minimale de PD-L1 (seulement 19,7 % des cas avec une expression ≥ 1 %), suggérant un bénéfice limité des approches standard d'immunothérapie. Cependant, les chercheurs ont identifié des mutations co-occurrentes fréquentes dans des gènes contrôlant la régulation épigénétique (57 % des cas), le contrôle du cycle cellulaire (26 %) et la réparation de l'ADN (24 %), indiquant des vulnérabilités thérapeutiques potentielles.

Ces résultats exigent des modifications immédiates des protocoles diagnostiques pour les cas suspects de carcinome NUT, en privilégiant les tests basés sur l'ARN ou l'immunohistochimie par rapport au séquençage standard de l'ADN. Les données moléculaires ouvrent également de nouvelles pistes pour le développement de thérapies ciblées contre cette maladie dévastatrice.